Prilikom odabira potpuno automatske centrifuge treba uzeti u obzir sljedeće faktore:
Brzina rotacije i centrifugalna sila: Različiti uzorci zahtijevaju različite brzine rotacije; odabir bi trebao biti zasnovan na stvarnim potrebama.
Kapacitet: Kapacitet bubnja određuje količinu obrađenog uzorka po ciklusu; industrijske primjene obično zahtijevaju veće kapacitete.
Materijal: Materijali otporni na -koroziju (kao što je nerđajući čelik) su pogodni za obradu hemijskih reagensa ili korozivnih uzoraka.
Održavanje i čišćenje: Jednostavan dizajn olakšava svakodnevno održavanje i čišćenje.